Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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