Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITSN1Q15811 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms