Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms