Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms