Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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UBE3CQ15386 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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UBE3CQ15386 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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