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| FHL3 | Q13643 | PNLDC1-202 | ENST00000392167 | 1816 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.05 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | HDHD2-201 | ENST00000300605 | 2212 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.05 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | LRIT1-201 | ENST00000372105 | 2228 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.05 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | LINC00612-201 | ENST00000538094 | 2213 nt | TSL 2 BASIC | 12.05 | □□□□□ -0.48 | | |
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| FHL3 | Q13643 | RDH10-201 | ENST00000240285 | 3949 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.05 | □□□□□ -0.48 | | |
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| FHL3 | Q13643 | KLHDC8A-201 | ENST00000367155 | 2928 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.04 | □□□□□ -0.48 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC073389.2-202 | ENST00000607450 | 441 nt | TSL 5 BASIC | 12.04 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | RDM1-220 | ENST00000616596 | 1032 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.04 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | RDM1-228 | ENST00000620284 | 1177 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.04 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL033527.5-201 | ENST00000641382 | 801 nt | BASIC | 12.04 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | ADAM15-228 | ENST00000531455 | 2678 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 12.04 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | LRRC20-206 | ENST00000395011 | 2903 nt | TSL 4 BASIC | 12.04 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | TRMT2A-202 | ENST00000403707 | 2928 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.04 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL121723.1-201 | ENST00000445194 | 1519 nt | BASIC | 12.04 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | RECQL4-210 | ENST00000621189 | 3896 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.04 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | NUP58-201 | ENST00000381718 | 2489 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 12.04 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | TBC1D4-202 | ENST00000377636 | 6364 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 12.04 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | GREB1-205 | ENST00000389825 | 1315 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.04 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | CICP13-201 | ENST00000422015 | 2789 nt | BASIC | 12.04 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | NR2C1-203 | ENST00000393101 | 1822 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.04 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | DGKZ-202 | ENST00000343674 | 3816 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 12.04 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | DHX30-205 | ENST00000445061 | 4065 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 12.04 | □□□□□ -0.48 | | |
| FHL3 | Q13643 | MICAL1-201 | ENST00000358577 | 3142 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.04 | □□□□□ -0.48 | | |