Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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