Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COX10Q12887 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
COX10Q12887 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
COX10Q12887 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
COX10Q12887 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COX10Q12887 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COX10Q12887 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
COX10Q12887 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COX10Q12887 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
COX10Q12887 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COX10Q12887 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COX10Q12887 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COX10Q12887 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.8 ms