Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2AQ12879 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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