Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TROQ12816 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TROQ12816 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TROQ12816 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TROQ12816 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TROQ12816 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TROQ12816 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TROQ12816 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TROQ12816 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TROQ12816 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TROQ12816 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TROQ12816 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TROQ12816 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TROQ12816 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TROQ12816 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TROQ12816 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TROQ12816 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TROQ12816 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TROQ12816 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TROQ12816 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TROQ12816 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TROQ12816 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TROQ12816 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TROQ12816 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TROQ12816 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TROQ12816 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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