Protein–RNA interactions for Protein: Q12756

KIF1A, Kinesin-like protein KIF1A, humanhuman

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1AQ12756 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KIF1AQ12756 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KIF1AQ12756 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KIF1AQ12756 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KIF1AQ12756 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KIF1AQ12756 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KIF1AQ12756 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KIF1AQ12756 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KIF1AQ12756 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KIF1AQ12756 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KIF1AQ12756 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms