Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms