Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms