Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XPCQ01831 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XPCQ01831 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XPCQ01831 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 545.6 ms