Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3AP98173 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms