Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLDN8P56748 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLDN8P56748 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLDN8P56748 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLDN8P56748 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLDN8P56748 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN8P56748 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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