Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME5P56597 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NME5P56597 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NME5P56597 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NME5P56597 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NME5P56597 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NME5P56597 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NME5P56597 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NME5P56597 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NME5P56597 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NME5P56597 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms