Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms