Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms