Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA3P35244 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms