Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPC1P35052 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPC1P35052 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPC1P35052 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GPC1P35052 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GPC1P35052 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPC1P35052 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GPC1P35052 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPC1P35052 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GPC1P35052 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GPC1P35052 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC1P35052 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms