Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms