Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB5P28074 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms