Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CTLA4P16410 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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