Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RGPD2P0DJD1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms