Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF2P04141 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF2P04141 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF2P04141 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF2P04141 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF2P04141 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF2P04141 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF2P04141 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF2P04141 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF2P04141 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF2P04141 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF2P04141 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms