Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POP4O95707 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POP4O95707 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms