Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ITM2AO43736 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ITM2AO43736 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ITM2AO43736 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ITM2AO43736 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ITM2AO43736 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ITM2AO43736 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ITM2AO43736 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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