Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ISM1B1AKI9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms