Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms