Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms