Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC180Q9P1Z9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms