Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms