Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6BQ9NRW1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms