Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms