Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms