Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms