Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms