Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms