Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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