Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms