Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms