Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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