Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms