Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms