Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms