Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms