Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms