Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms