Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY8

ARL13B, ADP-ribosylation factor-like protein 13B, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL13BQ3SXY8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL13BQ3SXY8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms